Hace unos días con la migración de mi disco SATA a un nuevo SSD en el portátil me encontré con el problema de que no me arrancaba por culpa del MBR.
Intenté ejecutar los comandos FIXBOOT y FIXMBR con el CD de recuperación pero no me los encontraba en el sistema.
En Windows 7/Vista ahora ya no existen dichos comandos. Se reemplaza por un solo comando: bootrec.exe
Para volver a reparar el MBR solo es necesario ejecutar la siguiente secuencia:
bootrec.exe /fixmbr
bootrec.exe /fixboot
Se debe hacer arrancando con el cd de instalación -> Reparar -> Mostrar consola de comandos (MS-DOS) y escribiendo los comandos anteriores. Una vez hecho esto el sistema tiene el MBR arreglado y vuelve a arrancar.
Espero que osa sirva de ayuda.